江南各地的卫所叛乱基本上得到平息。 给卫所兵卒分田分地的政策彻底瓦解了叛军的军心士气，使那些卫所将领很难得到下层卫所兵卒的支持，甚至选择反戈一击。 官军所至，叛军基本上是一触即溃。 这种情形使那些本有叛乱打算的也不敢再轻易发动，选择了隐忍。 而朱由哲则借机彻底清除江南的卫所兵制，贬斥罢黜了一些卫所将领，同时从中选取部分精壮补充京营，而将剩下兵卒的统治权归于当地官府。 这客观上加强了朝廷对地方军权的控制，特别是对江北与清军对峙区域有特别的意义。 清除卫所只在江南区域进行，也使各地的卫所将领陷入空前的恐慌中，纷纷上书请求朝廷终止这项决议，甚至出现了小规模的叛乱。 朱由哲当即下旨言明清除卫所是因...

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